Beogradska otvorena je vodeća organizacija u SEKO-u za ljudske resurse i članica konzorcijuma SEKO-a za reformu javne uprave. Sektorske organizacije civilnog društva (SEKO) predstavljaju konsultativni mehanizam koji je uspostavila Kancelarija za evropske integracije u cilju saradnje sa OCD u planiranju, programiranju, praćenju i izveštavanju o sredstvima EU i razvojnoj pomoći.

Regionalna mreža civilnog društva za praćenje reforme javne uprave „Veber" prati reformu javne uprave u državama Zapadnog Balkana. Beogradska otvorena škola članica je ove mreže od 2016. godine, a  ukupni cilj delovanja Mreže jeste da istakne značaj, poveća učešće i ojača civilno društvo na Zapadnom Balkanu tokom praćenja. 

U okviru programske oblasti Energija, klima i životna sredine, Beogradska otvorena škola je članica Kolacije 27, koja za cilj ima praćenje i doprinos EU pristupnim pregovorima u okviru Poglavlja 27 – Životna sredina i klimatske promene. Krou člansvto u ovoj mreži, BOŠ doprinosi procesu usklađivanja i primene politika i propisa Republike Srbije sa pravnim tekovinama EU u oblasti životne sredine i klimatskih promena i predlaže rešenja koja će doprineti zaštiti i unapređenju životne sredine i kvalitetu života.  

Beogradska otvorena škola je 2015. godine postala članica emintentnog poslovnog udruženja Američke privredne komore u Srbiji. BOŠ i AmCham su kroz partnersku saradnju pokrenule više inicijativa u oblasti razvoja ljudskih resursa, kao i povezivanja sveta obrazovanja i tržišta rada. Od 2016. godine BOŠ ima svoje predstavnike u AmCham HR odboru i AmCham Labor Regulations Task Force.

Beogradska otvorena škola članica je Krovne organizacije mladih Srbije od 2011. godine, a ujedno je i jedna od organizacija koja je učestvovala na osnivačkoj skupštini KOMS-a. BOŠ ima svog predstavnika u Upravnom odboru KOMS-a i aktivno doprinosi radu ove organizacije koja ima za cilj da zastupa interese mladih razvijajući partnerski odnos sa državom, međusektorsku i međunarodnu saradnju i da podstiče aktivno učešće mladih u razvoju društva Srbije. 

Beogradska otvorena škola je od 2015. godine članica udruženja Asocijacije onlajn medija, a ujedno je i jedan od osnivača ovog udurženja. Asocijacija onlajn medija ima za cilj razvoj i promociju etičkih standarda izveštavanja na internetu, afirmaciju slobodnog, nezavisnog i profesionalnog rada onlajn medija i promociju etičkih standarda i javnog interesa u sferi javnog informisanja, kao i jačanje uloge onlajn medija u demokratizaciji društva. Takođe, Beogradska otvorena škola ima svog predstavnika u Nadzornom odboru ovog udruženja.

Beogradska otvorena škola kao jedna od osnivača Registra nacionalnog interneta domena Srbije od 2007. godine u svom radu aktivno doprinosi razvoju interneta u Srbiji i pruža podršku u razvoju ove fondacije.

Beogradska otvorena škola je od 2015. godine članica prestižnog poslovnog udruženja Srpske asocijacije menadžera, koje ima za cilj unapređenje kapaciteta menadžera i promovisanje menadžerske profesije u Srbiji. Od 2017. godine BOŠ ima svog predstavnika u Upravnom odboru Srpske asocijacije menadžera.